Futbola Ankaragücü altyapısında başlayan Emre Kaplan, İstanbul Başakşehir’e transfer olduktan sonra Ümraniyespor, Bandırmaspor, Hatayspor ve Adanaspor gibi takımlarda forma giydi. 2020-2021 sezonunda kulübümüzde de görev yapan deneyimli oyuncu, 2026-2027 sezonu öncesinde yeniden yeşil-beyazlı formaya döndü. Sol bekin yanı sıra stoper ve sağ bek mevkilerinde de görev yapabiliyor.